在实验室建设时，选择净气型通风柜，需要根据实验内容来选择通风柜类型、材质、形状等。通常要考虑下列内容：
使用的药品：当使用有机物或其他特殊试剂实验时，要充分考虑其控制风速。热源：当使用带热源的设备时，其热量超过2000大卡/小时时要考虑排出热量所需的通风量从而确定通风机的功率。
有放射性物质或过氯酸等实验时：要选用的净气型通风柜，其进风风速必须设定大于0.5m/s。
使用大型设备进行实验时：要考虑内部的有效尺寸，为排风留出必要的空间。
材质：在使用特殊酸类实验时，要考虑通风柜的材质，例如半导体行业，腐蚀行业等必须要用防腐蚀的材料制造。
外形尺寸：根据实验内容选择其外形尺寸，体积太大造成浪费，过小影响使用。
环境保护：排出的有害气体必须确保低于国家环保要求，如果超过国家卫生标准，应安装相应的净化装置。
节省能源：尽量考虑节省能源，在有采暖或空调房间内应采用补风形通风柜或选择带风量控制的通风柜。在选择通风机时，也要根据需要确定其功率，不宜盲目增大排风量和压力，可采用变频器或变风速风机来降低电耗。
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